MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Arthrobacter aurescens TC1 plasmid TC2

Total Repeats: 6123

< Previous12345678910111213Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008713	CGG	2	6	294487	294492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952686
6002	NC_008713	TTG	2	6	294529	294534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119952686
6003	NC_008713	ACG	2	6	294619	294624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952686
6004	NC_008713	AGGGCG	2	12	294625	294636	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119952686
6005	NC_008713	GAC	2	6	294672	294677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952686
6006	NC_008713	CGA	2	6	294692	294697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952686
6007	NC_008713	CGG	2	6	294704	294709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952686
6008	NC_008713	TTC	2	6	294782	294787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_008713	TGG	2	6	294832	294837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119952664
6010	NC_008713	TCCT	2	8	294866	294873	0 %	50 %	0 %	50 %	119952664
6011	NC_008713	AGC	2	6	294881	294886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952664
6012	NC_008713	GGCCG	2	10	294964	294973	0 %	0 %	60 %	40 %	119952664
6013	NC_008713	GGCT	2	8	294981	294988	0 %	25 %	50 %	25 %	119952664
6014	NC_008713	AGT	2	6	295014	295019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119952664
6015	NC_008713	CGG	2	6	295020	295025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952664
6016	NC_008713	GCG	2	6	295032	295037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952664
6017	NC_008713	TGT	2	6	295067	295072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119952664
6018	NC_008713	CGGG	2	8	295084	295091	0 %	0 %	75 %	25 %	119952664
6019	NC_008713	TGG	2	6	295164	295169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119952664
6020	NC_008713	CCCG	2	8	295180	295187	0 %	0 %	25 %	75 %	119952664
6021	NC_008713	TGT	2	6	295240	295245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119952664
6022	NC_008713	GGTGT	2	10	295259	295268	0 %	40 %	60 %	0 %	119952664
6023	NC_008713	CTT	2	6	295335	295340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119952664
6024	NC_008713	CTC	2	6	295341	295346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119952596
6025	NC_008713	TTGG	2	8	295347	295354	0 %	50 %	50 %	0 %	119952596
6026	NC_008713	GTA	2	6	295401	295406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119952596
6027	NC_008713	CGT	2	6	295460	295465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952596
6028	NC_008713	GAC	2	6	295536	295541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952596
6029	NC_008713	CTG	2	6	295683	295688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952596
6030	NC_008713	GCA	2	6	295747	295752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952596
6031	NC_008713	CTTC	2	8	295843	295850	0 %	50 %	0 %	50 %	119952596
6032	NC_008713	TGA	2	6	296003	296008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119952596
6033	NC_008713	GTTG	2	8	296010	296017	0 %	50 %	50 %	0 %	119952596
6034	NC_008713	GCT	2	6	296072	296077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952596
6035	NC_008713	CCGGG	2	10	296096	296105	0 %	0 %	60 %	40 %	119952596
6036	NC_008713	CCA	2	6	296150	296155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119952596
6037	NC_008713	GA	3	6	296182	296187	50 %	0 %	50 %	0 %	119952596
6038	NC_008713	TTC	2	6	296224	296229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119952596
6039	NC_008713	CAA	3	9	296270	296278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119952596
6040	NC_008713	CAG	3	9	296322	296330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952596
6041	NC_008713	GAA	2	6	296352	296357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119952596
6042	NC_008713	CAA	2	6	296372	296377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119952596
6043	NC_008713	CCA	2	6	296381	296386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119952596
6044	NC_008713	TCGA	2	8	296450	296457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_008713	GCC	2	6	296554	296559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_008713	TGT	2	6	296721	296726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_008713	ATG	2	6	296765	296770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_008713	CGCC	2	8	296788	296795	0 %	0 %	25 %	75 %	119952743
6049	NC_008713	CG	4	8	296852	296859	0 %	0 %	50 %	50 %	119952743
6050	NC_008713	GCG	2	6	296940	296945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952743
6051	NC_008713	ACG	2	6	297003	297008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952743
6052	NC_008713	CCAG	2	8	297033	297040	25 %	0 %	25 %	50 %	119952743
6053	NC_008713	AG	3	6	297048	297053	50 %	0 %	50 %	0 %	119952743
6054	NC_008713	GGC	2	6	297060	297065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952743
6055	NC_008713	ACT	2	6	297074	297079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119952743
6056	NC_008713	TACCGG	2	12	297124	297135	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_008713	GGC	2	6	297224	297229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_008713	GC	3	6	297249	297254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_008713	CGA	2	6	297342	297347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_008713	TCA	2	6	297469	297474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_008713	AAAAG	2	10	297507	297516	80 %	0 %	20 %	0 %	119952680
6062	NC_008713	CTG	2	6	297520	297525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952680
6063	NC_008713	ACC	2	6	297589	297594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119952680
6064	NC_008713	CTC	2	6	297617	297622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119952680
6065	NC_008713	GCG	3	9	297730	297738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952680
6066	NC_008713	GACGCC	2	12	297820	297831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952680
6067	NC_008713	AGA	2	6	297876	297881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119952680
6068	NC_008713	TC	3	6	297884	297889	0 %	50 %	0 %	50 %	119952680
6069	NC_008713	GCG	2	6	297893	297898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952680
6070	NC_008713	GCC	2	6	297943	297948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119952680
6071	NC_008713	GGC	2	6	298057	298062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952680
6072	NC_008713	TTA	2	6	298073	298078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119952680
6073	NC_008713	GC	3	6	298180	298185	0 %	0 %	50 %	50 %	119952680
6074	NC_008713	CTCAG	2	10	298209	298218	20 %	20 %	20 %	40 %	119952680
6075	NC_008713	GCC	2	6	298242	298247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119952680
6076	NC_008713	CGG	2	6	298254	298259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952680
6077	NC_008713	CTC	2	6	298265	298270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119952680
6078	NC_008713	GAAC	2	8	298389	298396	50 %	0 %	25 %	25 %	119952680
6079	NC_008713	GCT	2	6	298420	298425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952680
6080	NC_008713	CT	3	6	298424	298429	0 %	50 %	0 %	50 %	119952680
6081	NC_008713	ACA	2	6	298430	298435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119952680
6082	NC_008713	CAA	2	6	298440	298445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119952680
6083	NC_008713	GCA	2	6	298498	298503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952680
6084	NC_008713	TTA	2	6	298547	298552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119952680
6085	NC_008713	ACA	2	6	298553	298558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119952680
6086	NC_008713	CAA	2	6	298565	298570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119952680
6087	NC_008713	G	7	7	298579	298585	0 %	0 %	100 %	0 %	119952680
6088	NC_008713	CA	3	6	298586	298591	50 %	0 %	0 %	50 %	119952680
6089	NC_008713	CG	3	6	298603	298608	0 %	0 %	50 %	50 %	119952680
6090	NC_008713	CCA	2	6	298611	298616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119952680
6091	NC_008713	GCTTGA	2	12	298688	298699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119952680
6092	NC_008713	GCTG	2	8	298773	298780	0 %	25 %	50 %	25 %	119952680
6093	NC_008713	GCC	2	6	298882	298887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119952680
6094	NC_008713	CAG	2	6	299000	299005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952680
6095	NC_008713	ACT	2	6	299047	299052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119952680
6096	NC_008713	ACG	2	6	299092	299097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952680
6097	NC_008713	ACC	2	6	299158	299163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119952680
6098	NC_008713	GGA	2	6	299205	299210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119952680
6099	NC_008713	GCA	2	6	299365	299370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952680
6100	NC_008713	GT	3	6	299376	299381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_008713	TCG	2	6	299423	299428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_008713	TGT	2	6	299444	299449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_008713	GGC	2	6	299498	299503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952670
6104	NC_008713	AC	3	6	299537	299542	50 %	0 %	0 %	50 %	119952670
6105	NC_008713	CTT	2	6	299588	299593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119952670
6106	NC_008713	GCT	2	6	299596	299601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952670
6107	NC_008713	CGG	2	6	299606	299611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952670
6108	NC_008713	GCC	2	6	299740	299745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119952670
6109	NC_008713	GGC	2	6	299799	299804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952670
6110	NC_008713	GT	3	6	299841	299846	0 %	50 %	50 %	0 %	119952670
6111	NC_008713	ACA	2	6	299896	299901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119952670
6112	NC_008713	ATG	2	6	299938	299943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119952670
6113	NC_008713	TGG	2	6	299991	299996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119952670
6114	NC_008713	CT	3	6	300001	300006	0 %	50 %	0 %	50 %	119952670
6115	NC_008713	TGG	2	6	300235	300240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119952612
6116	NC_008713	ATCAG	2	10	300266	300275	40 %	20 %	20 %	20 %	119952612
6117	NC_008713	TGT	2	6	300411	300416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_008713	ATCAG	2	10	300523	300532	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6119	NC_008713	TAG	2	6	300544	300549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_008713	TGA	2	6	300552	300557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_008713	CGC	2	6	300582	300587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_008713	TGATAG	2	12	300630	300641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_008713	GCTA	2	8	300687	300694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

< Previous12345678910111213Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.